Siden J.C. Jacobsens første Fundats- og Gavebrev fra 1876 er Carlsbergfondets fundats løbende blevet ændret. Det er sket som følge af en række beslutninger og begivenheder, der vedrører fondets ejerskab af Carlsberg A/S, fondets organisation samt relationen til fondets afdelinger og til Ny Carlsbergfondet: 1888: Carlsbergfondet overtager J.C. Jacobsens bryggeri, Gamle Carlsberg, efter bryggerens død. 1902: Carl og Ottilia Jacobsen skænker bryggeriet Ny Carlsberg til Carlsbergfondet. Samtidigt opretter de Ny Carlsbergfondet som et selvstændigt fond under Carlsbergfondet. 1916: Fordelingen af overskuddet fra Carlsberg Bryggerierne mellem Carlsbergfondet og Ny Carlsbergfondet fastsættes. Fra 1902 drives Carlsberg Bryggerierne af Carlsbergfondet som en selvstændig erhvervsvirksomhed. Det fortsætter, indtil bryggerierne i 1970 fusioneres med Aktieselskabet De forenede Bryggerier. 1970: Ved sammenslutningen vedtages det, at Carlsbergfondet skal eje mindst 51 procent af aktiekapitalen i De forenede Bryggerier A/S. 1987: De forenede Bryggerier A/S ændrer navn til Carlsberg A/S. 1991: Tuborgfondet fusioneres med Carlsbergfondet. 2013: Fundatsen ændres, således at Carlsbergfondet nu kun er forpligtet til at eje en aktiepost, der giver ret til mindst 51 procent af stemmerne i Carlsberg A/S. 2017: Carlsbergfondet overtager ejerskabet af Carlsberg Akademi. J.C. og Laura Jacobsens privatbolig fungerede som æresbolig fra 1911 til 1995. 2018: Fundatsen præciseres således, at Tuborgfondets bestyrelse fremover udgør en bevillingskomite, benævnt bestyrelse. Dette klargør, at det er Carlsbergfondets bestyrelse, der har bevillingskompetencen på baggrund af indstillinger fra bevillingskomiteen. Desuden foretages en række tilretninger og ændringer, som gennemføres for at tilpasse fundatsen til den gældende erhvervsfondslovgivning. 2020: Fundatsen tilpasses i overensstemmelse med en ændring af Ny Carlsbergfondets fundats, idet Ny Carlsbergfondets bestyrelse udvides fra tre til fem medlemmer. 2021: Fundatsens bestemmelser omkring konsolidering ændres således, at det er op til fondets bestyrelse at vurdere, om der det enkelte år er behov for konsolidering og i givet fald størrelsen af denne. 2022: Fundatsen ændres med henblik på at justere fondets organisering og ledelse, herunder muliggøre ansættelse af en direktør i fondet.